Seluruh fakultas, departemen, biro, pusat studi, organisasi mahasiswa, unit-unit dan lembaga-lembaga lain di bawah naungan UNDOVA dapat menggunakan logo sekunder dan tersier yang merupakan turunan dari logo UNDOVA. Logo sekunder menyertakan nama fakultas, departemen, biro, pusat studi, organisasi mahasiswa, unit-unit dan lembaga-lembaga lain dalam logo lock-up UNDOVA.
Penggunaan garis pemisah yang berwarna disesuaikan dengan warna masing-masing fakultas di antaranya adalah sebegai berikut:
Fakultas Ekonomi dan Bisnis : Merah
Fakultas Teknik dan Ilmu Komputer : Biru
Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan : Kuning
Fakultas Pertanian dan Perikanan : Hijau
Fakultas Ilmu Sosial, Politik dan Hukum : Orange
Aturan penggunaan logo sekunder dan tersier selaras dengan aturan-aturan umum dan khusus penggunaan logo UNDOVA. Logo sekunder dan tersier dapat digunakan untuk kebutuhan-kebutuhan spesifik masing-masing penggunanya.